Ajans Beşiktaş - 16 Haziran 1999 yılında Denizli'de dünyaya gelen genç oyuncu, sağ ve sol açık bölgesinde oynamaktadır. 1.70 cm boyunda olan ve futbola 2008 yılında Denizlispor altyapısında başlayan Atakan, 2016 yılında Denizlispor A Takımı'na yükseldi.

2016-2018 yılları arasında Denizlispor forması giyen Atakan Üner, yeşil siyahlı kulüp için 19 resmi maça çıktı. Bu maçlarda 818 dakika süre alan Atakan, 1 gol 3 asist katkısı yaptı.

11 Ocak 2017'de Sarayköy 1926 Kulübü'ne kiralıok olarak transfer oldu. 3. Lig Grup 3'te mücadele eden genç oyuncu, burada çıktığı 14 resmi maçta 1.104 dakika süre aldı. Atakan bu maçlarda 1 gol atma başarısı gösterdi.

1 Temmuz 2018 yılında Altınordu Kulübü'ne transfer olan Atakan Üner, İzmir ekibiyle 57 resmi maça çıktı. bu maçlarda 3.587 dakika süre alan genç futbolcu, 7 gol 10 asistlik performans sergiledi.

Altınordu'da gösterdiği performansla 3 büyüklerin dikkatini çeken Atakan, 2020-21 sezonunda tuttuğu takım olan Beşiktaş'a 150 bin Euro bonservis bedeli karşılığında transfer oldu.

Atakan Üner'in Transfermakt'ta yer alan güncel piyasa değeri ise 1.2 milyon Euro.